UNIVERSITATEA DE MEDICINĂ ȘI FARMACIE DIN CRAIOVA FACULTATEA DE MEDICINĂ CERCETĂRI ÎN DOMENIUL INTERPRETĂRII IMAGINILOR MEDICALE ȘI A DIAGNOSTICULUI ASISTAT DE CALCULATOR RESEARCH ON THE COMPUTER AIDED INTERPRETATION OF MEDICAL IMAGES AND DIAGNOSTIC TEZĂ DE ABILITARE REZUMAT Conferențiar Universitar Dr. Costin Teodor Streba Craiova 2018
Teza de abilitare intitulată "RESEARCH ON THE COMPUTER AIDED INTERPRETATION OF MEDICAL IMAGES AND DIAGNOSTIC" este structurată conform recomadărilor CNATDCU într-o parte introductivă și patru secțiuni principale. Partea introductivă prezintă o sinteză a activității de cercetare, didactice și științifice, prezentând în detaliu etapele carierii academice și a evoluției profesionale, precum și cele mai importante publicații și granturi de cercetare obținute prin competiție. Am absolvit Facultatea de Medicină din cadrul Universității de Medicină și Farmacie (UMF) din Craiova în anul 2008, în același an fiind selectat prin concurs să fac parte din grupul-țintă al unui proiect PosDRU pentru sprijinirea tinerilor doctoranzi. În septembrie 2011 am finalizat programul doctoral al UMF Craiova, cercetarea doctorală fiind intitulată Model integrativ de diagnostic și predicție a evoluției leziunilor focale hepatice. În paralel, am finalizat în anul 2010 programul de Master Managementul unităților sanitare din cadrul UMF Craiova. Am desfășurat în intervalul iulie 2014 septembrie 2015 un proiect postdoctoral în cadrul unui program PosDRU. În anul 2008 am început pregătirea ca medic pneumolog, în urma concurs național de rezidențiat. Odată cu obținerea titlului de Medic Specialist Pneumologie, am activat din anul 2014 în cadrul Spitalului Clinic Județean de Urgență Craiova. Am finalizat în anul 2017 a doua specialitate, fiind în prezent și Medic Specialist Gastroenterologie. Pe parcursul pregătirii continue ca medic am obținut multiple competențe: ecografie generală, bronhoscopie și endoscopie digestivă diagnostică. Cariera didactică am început-o în anul 2012, prin concurs, ca Asistent Universitar în cadrul disciplinei Pneumologie. În anul 2015 am promovat prin concurs Șef de Lucrări în cadrul disciplinei Metodologia Cercetării Științifice, iar din anul 2017 am promovat (prin concurs) Conferențiar Universitar în cadrul aceleiași discipline. Activitatea didactică include predarea cursurilor și lucrărilor practice studenților anului IV Facultatea de Medicină, seriile în limbă română și limbă engleză, și studenților an II Facultatea de Asistență Medicală din UMF Craiova. Sunt de asemenea titularului de curs Cercetarea în nursingul comunitar din cadrul programului de Master în Nursing Comunitar al UMF Craiova și colaborez la susținerea cursurilor doctorale Metodologiei Cercetării Științifice dedicate studenților doctoranzi anul I ai UMF Craiova. Până în prezent am publicat un număr de 47 lucrări in extenso în reviste indexate ISI, 27 ca autor principal și 30 articole (14 autor principal) în reviste indexate BDI. Am participat la redactarea a 7 capitole de carte în edituri internaționale, fiind autor al 4 volume apărute în edituri 2
naționale, o monografie în editură internațională, elaborând 4 cursuri didactice. Am obținut un Brevet de Invenție, alte 2 brevete fiind în curs de evaluare. Sunt recenzor pentru 17 reviste ISI. Am participat ca recenzor în trei competiții internaționale de proiecte (2013 Spania, 2016 și 2017 ERC-Like și SEE). Sunt membru al Editorial Board al World Journal of Hepatology (indexată ISI) și World Journal of Gastroenterology (cotată ISI, Factor de Impact 2017: 3,365), Scientific Manager al Current Health Sciences Journal (indexată BDI) și editor tehnic al Romanian Journal of Morphology and Embryology (cotată ISI). Sunt în prezent Director de Proiect al unui grant în desfășurare, cu titlul Unealta diagnostica asistată de calculator pentru tumori pancreatice folosind ecoendoscopie cu contrast și endomicroscopie confocală laser, fiind de asemenea membru în echipa altor șapte proiecte de cercetare finalizate cu succes, (IDEI 2011, PARTENERIATE 2011 și 2013 și un proiect internațional FP7), în calitate de membru principal al echipei de cercetare. Prima secțiune este dedicată prezentării aspectelor principale ale primei direcții de cercetare abordată odată cu încheierea studiilor doctorale, respectiv extinderea și îmbunătățirea modelului de diagnostic și predicție a evoluției formațiunilor tumorale hepatice și pancreatice. Carcinomul hepatocelular (CHC) reprezinta tumora malignă primară dezvoltată din hepatocite. Ocupă locul al treilea la nivel mondial ca mortalitate și al cincilea ca incidență, fiind al doilea ca mortalitate între cancerele digestive. Supraviețuirea este scăzută și în țările dezvoltate. România are cea mai mare rată de incidență brută și mortalitate între țările din Europa Centrală și de Est. Carcinomul pancreatic reprezintă unul dintre cele mai agresive tipuri de cancer. În prezent este a 4-a cauză a deceselor prin cancer. Incidența este în creștere, iar prognosticul este sumbru. Agenți de contrast de a doua generație utilizează bule de gaz între 2 și 7 microni in diametru, care rezonează în cu sonda ultrasonografică, semnalul amplificat fiind înregistrat de sistemul ecografic. Ecografia cu agenți de contrast este în prezent folosită în mod curent la diagnosticarea tumorilor hepatice. Ecoendoscopia combină endoscopul cu o sondă ecografică, fiind ideală pentru toate investigațiile non- sau minim-invazive ale pancreasului. Folosirea curbelor intensitate-timp în analiza filmelor ecografice este o metodă fezabilă de creștere a specificității. Metoda se bazează pe trasarea pe o scară de timp și compararea intensităților medii a două arii bine definite, una în interiorul tumorii iar cealaltă în aria adiacentă, fără vase majore, astfel obținându-se două grafice care descriu absorbția substanței de contrast. Reprezentarea grafică arată absorbția contrastului, urmată de wash-out-ul tumorii 3
în fazele portală și venoasă când intensitățile maxime sunt similare cu cele ale ariei de interes parenchimatoase. Tehnicile cantitative de analizare automată a imaginii au o importanță semnificativă în diverse domenii de evaluare micro sau macroscopică. Segmentarea automată a imaginii, cu extracția caracteristicilor și cuantificare suplimentară comparativă a elementelor independente, a fost implementată cu grade variabile de succes. Sistemele de diagnostic asistate de computer au câștigat reputațtia de a oferi soluții integrative pentru diagnosticul diferitelor tipuri de malignități. A doua secțiune prezintă cealaltă direcție principală abordată în cadrul activității de cercetare identificarea și folosirea unor markeri morfometrici inovativi în cadrul unui sistem computerizat pentru diagnosticul și stadializarea asistate de calculator a imaginilor anatomopatologice. Cancerul bronhopulmonar este primul între toate tipurile de tumori maligne, unul dintre cele mai letale cancere la nivel mondial, fiind mai frecvent cancer la barbați. Cu patru tipuri histologice majore existente, acesta este una dintre cele mai heterogen tumori maligne. Ecobronhoscopia (EBUS) necesită utilizarea unui bronhoscop echipat cu o sondă convexă sau liniară la vârful său, care oferă informații din interior spre exterior din trahee și arborele bronsic. Este utilă pentru stadializare și proceduri minim invazive, putând beneficia de agenți de contrast. Toate metodele de măsurare a dimensiunii fractale sunt bazate pe relația dintre magnitudine și profilul distribuției spațiale a ariei de referință. Deși numeroase tipuri de dimensiuni fractale au fost propuse în literatură, modelele înaintate de Hausdorff si Kolmogorov par a fi cele mai potrivite pentru analiza cantitativă în imagistica medicală. Metodele computerizate pot fi folosite pentru cuantificarea precisă a caracteristicilor, care pot fi ulterior clasificate și analizate. Analiza fractală a imaginii și, în special, determinarea dimensiunilor fractale ale ariilor care aparțin zonelor de interes în orice imagine digitalizată este o unealtă folositoare pentru clasificarea numerică și interpretarea caracteristicilor. Poate fi folosită atât pe imagini histologice asigurând o cuantificare a elementelor patologice, cu aplicarea și algoritmilor de fractal box counting. A treia secțiune prezintă succint planurile de viitor privind cariera academică și profesională. Am prezentat principalele două proiecte care continuă direcțiile actuale de cercetare. Primul proiect dorește conceperea și implementarea unui sistem de diagnostic, bazat pe inteligență artificială, capabil să interpreteze curbele intensitate-timp rezultate în urma eco 4
endoscopiei cu agenți de contrast folosită pentru diagnosticul tumorilor pancreatice, și corelarea acestor date cu cele obținute în urma analizei semi-automate a imaginilor obținute prin altă tehnică endoscopică inovativă endomicroscopia confocală laser pe bază de miniprobe (pcle). Cel de-al doilea proiect de viitor vizează interpretarea a imaginilor obținute prin pcle, aplicat în evaluarea căilor aeriene și a formațiunilor tumorale pulmonare, obținându-se o biopsie optică in situ. Rolul evaluării în timp real a țesutului pulmonar și al căilor aeriene de diverse calibre reprezintă o noutate pe plan mondial, în prezent existând extrem de puține studii în acest sens. A patra secțiune prezintă lista celor mai importante referințe bibliografice folosite pentru a ilustra principalele descoperiri în domeniu și implicațiile clinice ale cercetărilor propuse. 5